Le Pôle Végétation Aquatique met à disposition différents équipements d’observations et d’expérimentations in situ (terrain) et ex situ (salles expérimentales et laboratoire). Ces équipements (espaces de travail, matériels) sont principalement dédiés à l’étude en eau douce (cours d’eau et plan d’eau) des communautés végétales aquatiques (macrophytes, phytoplancton, phytobenthos). Ils peuvent également être utilisés sur d’autres milieux et/ou dans le cadre de formation interne et/ou académique. 

Matériel d'observation et d'expérimentation, in situ et ex situ

Une liste non exhaustive du matériel détenu et géré au sein du pôle est présentée ci-après.

• préleveurs automatiques et manuels d’eau
• préleveurs manuels de sédiments (benne Van Veen, benne Eckman, carottier)
• filets à plancton
• surber
• pompes filtration manuelles et électriques
• fluorimètres de terrain et de laboratoire dont :

- algae Torch® est un instrument étanche, utilisé en milieux aquatiques pour la quantification des cyanobactéries et du phytoplancton total. Il permet de déterminer rapidement la concentration en Chlorophylle- a du phytoplancton total et celle provenant des cyanobactéries et la mesure de turbidité,

- fluoroprobe® : est un instrument de terrain utilisé en milieux aquatiques pour l’analyse du phytoplancton et du phytobenthos. Cette sonde bbe spectrofluorimétrique est immergeable et permet d’obtenir la concentration en μg équivalent de chl a.L^-1 de diverses classes algales, en continu par exemple le long de la colonne d’eau d’un plan d’eau. Elle permet de mesurer les paramètres suivants : la profondeur; la température ; la transmission ; la concentration en chlorophylle a totale reflétant la quantité d’algues présentes dans le milieu des différents groupes algaux (Chlorophycées ; Cyanobactéries ; Diatomées ; Cryptophytes et substances jaunes),

- 3 fluorimètres (PHYTO-PAM®, Imaging-PAM®, DIVING-PAM®) permettent de mesurer les performances photosynthétiques : des différents groupes algaux présents dans le phytoplancton, les biofilms, et les macrophytes.

• 1 Firesting-02® (Oxymètre optique) permettant de suivre en continu l’évolution de l’oxygène dissous lors des périodes de photosynthèse ou de respiration

• instrument de mesure de rayonnement lumineux : composé d’un boitier (LI-COR 250) associé soit à un capteur LI-193SA Spherical Quantum Sensor, (ampoule), soit à  un capteur LI-190SA Quantum Sensor. Ces capteurs mesurent dans l’air et/ou dans l’eau, le rayonnement photosynthétique actif (le PAR), c’est à dire la lumière utilisée par les plantes pour la photosynthèse (comprise entre 400 et 700 nm)
• courantomètre : un FLO MATE 2000 de la marque MARSH McBIRNEY permet le mesurage en ponctuel de la vitesse d’écoulement d’un liquide à l’aide d’un capteur électromagnétique directionnel. Il est adapté pour des mesures de vitesses moyennes à élevées (0.00 à 2.50 m/s)
• différents capteurs multiparamétriques (température, pH, conductivité, oxygène dissous)
• échosondeurs
• Gps centimétrique
• agitateurs
• tamis
• aquascope
• dispositifs expérimentaux :

- assortiment de cagettes de collecte de biofilms,

- cloches benthiques.

 

Salle métrologie

Une salle de métrologie permet de maintenir le matériel d’XPO au meilleur niveau. Cette salle permet de réaliser l’ensemble des opérations liées à la métrologie.

Principaux équipements de cette salle métrologie

• 6m de paillasse humide et sèche fixe de 6m
• point d’eau (chaud, froid)
• climatisation
• 1 sorbonne à recirculation de 1 m
• réfrigérateur

 

Salle de stockage des échantillons en attente de traitement

 

 

 

 

 

 

 

Principaux équipements

• 1 armoire de sécurité ventilée (uniquement pour les échantillons avec solution de fixation)
• 1 armoire réfrigérée
• climatisation possible de la salle

 

Salle dédiée à la préparation des échantillons

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Principaux équipements

• 14 m de paillasse humide fixe
• 1 paillasse mobile sèche de 1,5 m
• 2 étuves
• 1 armoire réfrigérée
• réseau de vide d’air
• réseau de gaz de ville
• 1 armoire de sécurité ventilée (dédiée aux produits chimiques)
• 1 centrifugeuse
• 1 sorbonne de 1,5 m
• 1 sorbonne de 1,8 m
• 1 douche de sécurité
• nécessaire de préparation de lames permanentes de diatomées
• 1 centrale de production d’eau déminéralisée
• 1 table d’agitation
• 1 laveur de matériel de laboratoire (verre, plastique), thermo-désinfection possible

 

Salle d’observation et de détermination macro et microscopique

Trois salles comprenant plusieurs postes d’observations sont dédiées à la caractérisation (phénotypage) et à la détermination (taxinomie) d’échantillons de microorganismes aquatiques (phytoplancton, phytobenthos et micro-méiofaune) et de végétaux aquatiques (macrophytes). Les observations sont réalisées à l'aide d'outils macro et microscopiques tous équipés d’un système d’acquisition vidéo numérique. Ces salles contiennent une ressource documentaire importante d’ouvrage de taxinomie (micro-algues, micro-méiofaune, macrophytes). Deux de ces salles peuvent être opacifiées pour permettre des observations en épifluorescence par exemple.

 

 

 

 

 

Principaux équipements

• 6 paillasses sèches de 13 m
• 7 microscopes (5 droits et 2 inversés) dont 1 équipé pour l’épifluorescence. Les objectifs s'échelonnent du x1,5 à x100 à sec ou à immersion (pouvant permettre d’observer jusqu’à x2500). Les microscopes sont équipés suivant les modèles en : fond clair (BF), fond noir (DF), contraste interférentiel différentiel (DIC), contraste de phase (Cph), fluorescence (FL) ou polarisation (POL). Certains sont équipés d’éclairage transmis et/ou incident, de platines motorisées
• Progiciels associés permettant de faire de l’analyse d’images
• 1 micromanipulateur permettant de sélectionner des microorganismes
• 1 loupe binoculaire
• 1 mantis

 

Salles des mesures des paramètres abiotiques et biotiques

Une salle de mesure de paramètres physiologiques est plutôt dédiée aux objets d’études biofilms et phytoplancton, et une salle de biométrie est dédiée aux macrophytes.

Principaux équipements de la salle de mesures des paramètres physiologiques

• 6m de paillasse humide fixes
• réseau de vide d’air
• 1 cytomètre de flux couplé à un microscope photonique x4, x10 et x20 (FlowCam®), équipé pour détecter la fluorescence émise par la chlorophylle. L’appareil génère grâce à une caméra couleur, des images numériques des particules détectées selon les paramètres définis par l’utilisateur. Ces images donnent accès à 64 paramètres de mesures en 2 dimensions (taille, forme, etc.) permettant ainsi de les classifier selon des filtres d’imagerie définis par l’utilisateur
• 3 fluorimètres (PHYTO-PAM®, Imaging-PAM®, DIVING-PAM®) (cf Matériel utilisable in situ et ex situ)
• 1 Firesting-02® (Oxymètre optique) (cf Matériel utilisable in situ et ex situ)
• salle pouvant être totalement opacifiée et climatisée

Principaux équipements de la salle de biométrie

• 2 étuves
• 3 m de paillasse sèche amovibles
• balances de pesées de précision
• point d’eau (chaud, froid)
• réfrigérateur

 

Salles d’expérimentations ou de culture d'organismes sous conditions contrôlées (température, lumière)

Cinq salles sont dédiées principalement aux expérimentations sur micro-algues et végétaux aquatiques (macrophytes). Exemples d’expérimentations réalisées : tests de toxicité des micropolluants sur biofilms (notamment pesticides, métaux), tests de germination, tests de croissance.

Principaux équipements communs de ces salles d’expérimentation

• système d’éclairage (LED) programmable (ex : cycle jour et nuit, intensité lumineuse)
• ces salles peuvent être opacifiées pour permettre des expérimentations à l’obscurité
• canaux expérimentaux et aquariums de différentes dimensions,
• bioréacteur annulaire
• pompes péristaltiques et immergées
• tables d’agitation
• armoires réfrigérées, congélateur à -80°C disponibles à proximité,
• toutes équipées d’un réseau informatique filaire et Wifi reliés aux serveurs informatiques du site
• tous les outils et moyens liés aux observations et acquisition de données du pôle PVA

La station d'expérimentation de Saint Seurin sur l'Isle peut permettre également de réaliser d’autres types d’expérimentations sur la communauté végétale aquatique.

 

Salle expérimentation n°1

Cette salle de 8 m² avec une hauteur sous plafond de 3,0 m, permet d’accueillir des expérimentations et/ou cultures sur paillasses et en incubateurs. Un autoclave est à proximité de cette salle.

 

 

 

 

Principaux équipements, salle expérimentation n°1

• Plusieurs incubateurs de culture permettant de réguler la température et la luminosité (ex : cycle jour et nuit, intensité lumineuse) indépendamment l’une de l’autre
• réseau de vide d’air
• réseau de gaz de ville
• paillasse humide fixe de 3 m
• point d’eau (chaud, froid)
• 1 poste de sécurité microbiologique (PSM)
• table antivibration pour des mesures par balances de précisions

 

Salle expérimentation n°2

Cette salle de 25 m² avec une hauteur sous plafond de 2,5 m, permet d’accueillir des expérimentations sur paillasses ou au sol.

Principaux équipements, salle expérimentation n°2

• 11 mètres de paillasses humides fixes
• point d’eau (chaud, froid)
• évacuation possible des eaux non souillées au sol

 

Salle expérimentation n°3

Elle est particulièrement modulable, avec des paillasses amovibles (jusqu’à 6 m de paillasse) permettant d’utiliser l’ensemble du volume de cette pièce (36 m³, 12 m²).

 

 

 

 

 

 

 

Principaux équipements, salle expérimentation n°3

• 3 m de paillasses sèche amovible
• une structure d’expérimentation amovible permet de moduler l’espace de travail,  en longueur (jusqu’à 3 m de long), en profondeur (jusqu’à 1 m de profondeur), et en hauteur (jusqu’à 2 m)
• point d’eau (chaud, froid)
• évacuation possible des eaux non souillées au sol

 

Salle expérimentation n°4

Cette salle de 44 m² permet d’accueillir des expérimentations nécessitant des structures expérimentales de gros volume, elles peuvent être déposées directement au sol ou sur paillasses.

Principaux équipements, salle expérimentation n°4

• 10 mètres de paillasses sèche amovibles
• hauteur sous plafond de 6 m
• évacuation possible des eaux au sol
• point d’eau (chaud, froid)
• armoire réfrigérée
• 1 Congélateur (-18°c)

 

Salle expérimentation n°5

Cette salle de 19 m² avec une hauteur sous plafond de 3,6 m, permet d’accueillir des expérimentations nécessitant des structures expérimentales de gros volume, elles peuvent être déposées directement au sol ou sur paillasses.

Principaux équipements, salle expérimentation n°5

• 7 m de paillasse sèche amovibles et 1,5 m de paillasse sèche fixe
• une structure d’expérimentation amovible permet de moduler l’espace de travail,  en longueur (jusqu’à 3 m de long), en profondeur (jusqu’à 1 m de profondeur), et en hauteur (jusqu’à 2 m)
• point d’eau (chaud, froid)